scRNA-q和snRNA-q有什么區(qū)別?

1、總結scRNA-q與snRNA-q的區(qū)別，scRNA-q面臨應用范圍受限、容易引發(fā)細胞轉錄偏好和細胞類型偏好等問題，而snRNA-q優(yōu)勢在于避免解離偏差和轉錄偏好，同時適用于凍存組織，但在分析中丟失了細胞質中的轉錄本信息。

2、scRNA-q與snRNA-q在應用場景和優(yōu)勢上有所不同。scRNA-q在新鮮組織樣本中表現(xiàn)優(yōu)異，能夠提供全面的基因表達圖譜，適合于細胞類型多樣性的研究。而snRNA-q則在處理冷凍樣本時表現(xiàn)出色，為單細胞技術在更廣泛樣本類型中的應用提供了可能性。

3、- 基因數(shù)量與特性：scRNA-q包含線粒體和核糖體基因，而snRNA-q由于關注核心轉錄，這些基因相對較少。- 整合與分析：盡管Seurat分析流程相似，但兩者的質量控制（QC）標準不同，snRNA-q可能需要更為寬容的參數(shù)設置，以保留更多數(shù)據。

4、綜合來看，細胞和核RNA-q結合提供更全面的細胞類型響應基因揭示，并揭示了轉錄表達的深度。盡管各有優(yōu)勢，但核分析在特定情況下更敏感，且能彌補細胞分析的不足（圖1e和f）。